海关允许存放保税仓库的货物有三类：

一是供加工贸易（进、来料加工）加工成品复出口的进口料件；

二是外经贸主管部门批准开展外国商品寄售业务、外国产品维修业务、外汇免税商品业务及保税生产资料市场的进口货物；

三是转口贸易货物以及外商寄存货物以及国际航行船舶所需的燃料、物衬和零配件等。
保税仓库分公用型和自用型两类。公用型保税仓库是根据公众需要设立的，可供任何人存放货物。自用型保税仓库是指只有仓库经营人才能存放货物的保税仓库，但所存放货物并非必须属仓库经营人所有。