保税仓库的作用主要体现在几个方面：


保税仓库有利于促进对外贸易。国际贸易实务中，从询价、签订合同，到货物运输需要较长的时间，为缩短贸易周期，降低国际市场价格波动的影响，先将货物运抵本国口岸，预先存入保税仓库，可使货物尽快投入使用，也可先将货物存入保税仓库，待价格时机再进入市场。

保税仓库有利于提高进口原材料的使用效益。利用保税仓库，可以使需要进口的原材料统一进口，相互调剂，提高原材料的利用率，降低进口价格，提高经济效益。


保税仓库有利于开展多种贸易方式，发展外向型经济。利用保税仓库的纳关税等优惠条件，发展多种贸易方式，如来料加工;有利于扩大出口，增加外汇收入;还可利用价格变化中的差价，开展转口贸易。


保税仓库有利于加强海关监管。保税仓库出现后，海关工作人员可以借助仓库管理人员的力量进行协同管理，海关主要是制定各种管理制度，对保税仓库出入的货物实行核销监督管理，对加工业实行重点抽查与核销，以防内销行为的出现。增强了海关监管力度，同时简化了手续。